Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC9A1P19634 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC9A1P19634 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.6 ms