Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTPS1P17812 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms