Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DESP17661 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DESP17661 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DESP17661 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms