Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GOT1P17174 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GOT1P17174 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOT1P17174 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOT1P17174 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOT1P17174 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOT1P17174 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GOT1P17174 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms