Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRCP08575 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRCP08575 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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