Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EDN1P05305 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EDN1P05305 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EDN1P05305 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EDN1P05305 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms