Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB3P05106 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms