Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms