Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VTNP04004 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VTNP04004 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VTNP04004 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VTNP04004 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms