Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
F9P00740 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
F9P00740 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms