Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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