Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ZNF343-202ENST00000358413 771 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HSD17B3-202ENST00000375263 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HNRNPA1P34-201ENST00000391992 950 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 LDHAL6FP-201ENST00000405916 1082 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PHGR1C9JFL3 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms