Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms