Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGPD3A6NKT7 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RGPD3A6NKT7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms