Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F8A0AVK6 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms