Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIF3AQ9Y2N7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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