Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP20Q9Y2K6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms