Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CNTNAP2Q9UHC6 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms