Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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COPS7AQ9UBW8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COPS7AQ9UBW8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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