Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CC2D2AQ9P2K1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CC2D2AQ9P2K1 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms