Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
TBCCD1Q9NVR7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TBCCD1Q9NVR7 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms