Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM30AQ9NV96 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms