Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCAPERQ9BY12 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms