Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRRTQ9BXP5 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms