Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
SSBP4Q9BWG4 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
SSBP4Q9BWG4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms