Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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IFT27Q9BW83 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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IFT27Q9BW83 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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IFT27Q9BW83 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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IFT27Q9BW83 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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IFT27Q9BW83 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
IFT27Q9BW83 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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