Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUP58Q9BVL2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms