Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AL590428.1-201ENST00000428865 1973 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms