Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TUBGCP5Q96RT8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TUBGCP5Q96RT8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms