Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SGCZQ96LD1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SGCZQ96LD1 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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