Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms