Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RNFT2Q96EX2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RNFT2Q96EX2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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RNFT2Q96EX2 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNFT2Q96EX2 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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