Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.1 ms