Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPS3Q969F9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms