Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCAMP4Q969E2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SCAMP4Q969E2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms