Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C1orf54Q8WWF1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1orf54Q8WWF1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms