Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GIPC3Q8TF64 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms