Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC112Q8NEF3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC112Q8NEF3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms