Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RASGEF1AQ8N9B8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1AQ8N9B8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1AQ8N9B8 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1AQ8N9B8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1AQ8N9B8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1AQ8N9B8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RASGEF1AQ8N9B8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms