Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC84Q86UT8 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms