Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTOP1Q7RTM1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTOP1Q7RTM1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTOP1Q7RTM1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms