Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HECW1Q76N89 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms