Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMBR1LQ6UX01 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms