Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSSK4Q6SA08 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms