Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC174Q6PII3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms