Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC9A4Q6AI14 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms