Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TWISTNBQ3B726 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms