Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM71Q2Q1W2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM71Q2Q1W2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms