Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PFKFB3Q16875 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms