Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CLPPQ16740 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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